From: Bioinformatics analysis of epitope-based vaccine design against the novel SARS-CoV-2
Peptides | Position | HLA class-II alleles | Vaxijen score |
---|---|---|---|
IKLDDKDPN | 337–345 | DRB1_0701, DRB1_0301, DRB3_0101, DRB1_0405, DPA1_0301/DPB1_0402, DQA1_0101/DQB1_0501, DRB1_0901, DRB1_1101, DRB5_0101, DRB4_0101, DRB1_0101, DRB1_1302, DQA1_0501/DQB1_0301, DPA1_0103/DPB1_0201, | 2.3118 |
RSGARSKQR | 32–40 | DRB5_0101, DRB4_0101, DQA1_0501/DQB1_0301 | 1.7874 |
RIGMEVTPS | 319–327 | DRB1_1101, DRB1_0401, DRB1_0405, DQA1_0102/DQB1_0602, DRB1_0802, DRB1_0301, DPA1_0301/DPB1_0402, DRB4_0101, DQA1_0501/DQB1_0301, DRB1_0901, DRB5_0101, DQA1_0401/DQB1_0402, DRB1_0101, DRB1_0701, DQA1_0501/DQB1_0201, DRB1_1501, DPA1_0201/DPB1_0101, DPA1_0103/DPB1_0201 | 1.5314 |
RGTSPARMA | 203–211 | DQA1_0501/DQB1_0301, DRB1_0901, DQA1_0102/DQB1_0602 | 1.2953 |
LSPRWYFYY | 104–112 | DRB1_0405, DQA1_0101/DQB1_0501, DPA1_0103/DPB1_0201, DPA1_0201/DPB1_0501, DRB3_0101, DRB1_1201, DRB1_1302, DPA1_0201/DPB1_0101, DRB1_0901, DQA1_0501/DQB1_0201, DRB1_1501, DRB1_1101, DRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0701, DPA1_0301/DPB1_0402, DRB5_0101, DRB1_0301 | 1.2832 |
PRGQGVPIN | 67–75 | DQA1_0501/DQB1_0301, DRB1_1302, DRB1_0101, DRB1_0901, DRB1_0401, DRB1_0701, DRB1_1501, DRB1_0405 | 1.1707 |