Skip to main content

Table 3 The allele-specific real-time PCR results with the samples from 42 patients

From: Establish an allele-specific real-time PCR for Leishmania species identification

Diseases

Patients ID

Testing results Ct (SD)

Sequencing results

Diseases

Patients ID

Testing results Ct (SD)

Sequencing results

L. donovani

L. infantum

L. major

L. tropica

L. donovani /infantum

VL

1

un

30.7 (0.3)

L. infantum

CL

23

30.1 (0.3)

un

un

L. major

2

un

34.4 (0.1)

L. infantum

24

30.0 (0.3)

un

un

L. major

3

un

34.8 (0.3)

L. infantum

25

26.4 (0.1)

un

un

L. major

4

un

33.7 (0.2)

L. infantum

26

28.2 (0.2)

un

un

L. major

5

un

33.2 (0.2)

L. infantum

27

29.7 (0.2)

un

un

L. major

6

un

36.8 (0.4)

L. infantum

28

32.3 (0.6)

un

un

L. major

7

un

27.1 (0.1)

L. infantum

29

35.6 (0.4)

un

un

L. major

8

un

31.0 (0.1)

L. infantum

30

26.2 (0.1)

un

un

L. major

9

un

33.8 (0.2)

L. infantum

31

25.6 (0.1)

un

un

L. major

10

29.43 (0.16)

un

L. donovani

32

27.2 (0.2)

un

un

L. major

11

27.66 (0.15)

un

L. donovani

33

32.3 (0.4)

un

un

L. major

12

un

27.0 (0.3)

L. infantum

34

29.4 (0.2)

un

un

L. major

13

un

35.9 (0.4)

L. infantum

35

27.6 (0.2)

un

un

L. major

14

un

31.7 (0.3)

L. infantum

36

28.3 (0.4)

un

un

L. major

15

un

36.1 (0.5)

L. infantum

37

28.3 (0.6)

un

un

L. major

16

un

38.5 (0.4)

L. infantum

38

29.8 (0.1)

un

un

L. major

17

un

33.4 (0.7)

L. infantum

39

28.8 (0.2)

un

un

L. major

18

un

26.4 (0.1)

L. infantum

40

26.4 (0.4)

un

un

L. major

19

34.45 (0.39)

un

L. donovani

41

29.1 (0.4)

un

un

L. major

20

un

31.2 (0.1)

L. infantum

42

35.0 (0.4)

un

un

L. major

21

un

29.2 (0.3)

L. infantum

     

22

un

25.3 (0.3)

L. infantum

     
  1. Ct cycle threshold, SD standard deviation, VL visceral leishmaniasis, CL cutaneous leishmaniasis, un undetected